El Logotipo de la Asociación Cooperadora FCN fue aprobado en 2018 (reunión de Comisión Directiva del día 13 de junio de 2018).

Fue realizado por Eric Brian BULAN GEORGIEFF y Mariana LEAL, estudiantes  de la Carrera de Licenciatura en Ciencias Biológicas de la Facultad de Ciencias Naturales e IML UNT, quienes ganaron un concurso realizado por la Comisión Directiva para la confección de logotipo.

En el mismo están representadas todas las carreras: Tecnicatura Universitaria en Documentación y Museología Arqueológica (icono de Museo), Licenciatura en Ciencias Biológicas (un microscopio), Profesorado en Ciencias Biológicas (un docente dando clase sobre célula), Geología (una piqueta) y Arqueología (una vasija y una cucharín), todas unidas por el icono de colaboración y solidaridad